浓度为0.01%~46.0%的苯甲酸苄酯可用于肌内注射的增溶剂和非水溶剂，另外其可作为纤维素的溶剂和增塑剂，、也用于喷雾干燥法制备纳米胶囊粉末。 药学中广泛应用于局部给药治疗疥疮，此外兽医中可用作驱虫药。 苯甲酸苄酯还可应用作灭虱药，化妆品和食品中的溶剂及香料固定剂。